В апреле 2021 года Черноморо-Азовским морским управлением Росприроднадзора была проведена плановая выездная проверка в отношении АО «Новорослесэкспорт». В ходе надзорных мероприятий около района № 5 Контейнерного терминала АО «НЛЭ» было установлено, что на поверхности участка акватории Черного моря накапливается мусор: отходы пенопласта на основе полистирола, отходы (остатки) фруктов, овощей, смет с территории предприятия, тара полиэтиленовая, тара стеклянная, растительные отходы и др. Общая площадь загрязнения составила 150 м2. Это повлекло причинение вреда окружающей среде.
По данному факту Черноморо-Азовским морским управлением Росприроднадзора на основании «Методики исчисления размера вреда, причинённого водным объектам вследствие нарушения водного законодательства» был рассчитан и предъявлен вред, сумма которого составила 2 млн 847 тыс. 285 рублей. В случае отсутствия добровольной оплаты в течение месяца со дня получения претензии сумма вреда будет взыскана Управлением в судебном порядке.